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    生物通首頁 > 今日動態 > 專題總匯 > LncRNA:從分子調控到臨床應用的最新成果2016版


           康成生物工程有限公司(簡稱“康成生物”)自2002年起專注于高通量篩選實驗服務,是國內最早一批專業提供生命科學前沿研究技術服務的高科技企業。康成生物以lncRNA、microRNA、表觀遺傳學相關檢測技術作為核心研發方向,是Agilent、Arraystar、Exiqon、SABiosciences等國際知名芯片品牌的服務代理商。

           2009年,隨著非編碼RNA(ncRNA)研究進展的深入,一類新的ncRNA分子—lncRNA掀起科學界的熱點話題,并逐漸成為分子生物學及臨床醫學研究的重要方向。康成生物與美國Arraystar公司合作,利用Arraystar LncRNA系列芯片平臺,率先開展lncRNA表達篩查服務。Arraystar公司是LncRNA研究領域的先驅和領導者,是lncRNA表達譜檢測的首選平臺。2016年最新推出的第四代LncRNA芯片,來源于最新最全的數據庫,并采用嚴格的篩選程序和轉錄本特異性設計,同時檢測LncRNA和mRNA,芯片注釋LncRNA基因組信息、分類及潛在的調控機制,為深入研究LncRNA復雜生物學功能提供參考信息。迄今為止,作為Arraystar中國區唯一代理商,康成客戶采用Arraystar LncRNA芯片已發表SCI論文超過160篇,其中多篇發表在Cancer Cell, Mol Cell,Hepatology等國際頂尖雜志上。

    LncRNA研究背景及其與疾病的關系




      Arraystar LncRNA芯片:

    LncRNA芯片技術的領跑者:目前Arraystar發布了最新版本的人類V4.0 LncRNA芯片和小鼠V3.0 LncRNA芯片。
    經典與創新的碰撞:收錄金標準LncRNAs,可靠的LncRNAs以及編碼蛋白的mRNAs,更新、更全面。
    系統而實用的LncRNA注釋:注釋LncRNA基因組信息、分類及潛在的調控機制,為深入研究lncRNA復雜生物學功能提供參考。
    轉錄本特異性的探針設計:芯片探針可以準確地檢測同一基因的不同轉錄本。

    Arraystar公司 LncRNA芯片


      LncRNA在臨床醫學研究中的新成果:

    LncRNA是臨床醫學研究中新興的熱點分子,可以通過不同的分子生物學機制調控編碼基因的表達,參與疾病相關的信號通路,從而對疾病的發生、發展及治療有重要作用。作為一類新型的具有生物學功能的臨床標志物,lncRNA具有非常廣闊的臨床應用前景。利用Arraystar公司lncRNA芯片,近年來,國內外學者發表一系列高水平科研論文,幫助我們進一步認識lncRNA在疾病的重要作用,開拓臨床醫學研究的視野,并對我們后續的科研有進一步的指導意義。


       
      為什么選用LncRNA芯片比RNA-seq更合適:

    LncRNAs比蛋白編碼RNAs表達水平低
    RNA-seq對于低豐度轉錄本的定量不準確
    增加測序深度不能提高低豐度轉錄本的檢測準確度
    RNA-Seq不能精確定量lncRNA與RNA-Seq數據分析不成熟密切
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    芯片比RNA-Seq更適合低豐度lncRNAs 表達譜的檢測

    Arraystar LncRNA芯片:比RNA-seq更適合于LncRNAs表達譜檢測


      (1)LncRNA與癌癥:

    癌癥相關的研究是進展最快,成果最豐富的領域。研究者利用Arraystar LncRNA芯片對不同癌癥的發生、發展等進行了深入研究。

    Cell最新發表應用Arraystar LncRNA芯片研究乳腺癌的文章
    Cancer Cell最新發表應用Arraystar LncRNA芯片研究肝癌的文章
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    J Natl Cancer Inst最新發表:應用Arraystar LncRNA芯片研究結直腸癌 New!
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      Arraystar ncRNA Promoter 芯片:

    Arraystar 啟動子芯片是專門為研究啟動子區域的甲基化,羥甲基化,組蛋白修飾以及轉錄因子結合而設計的產品,覆蓋所有RefSeq數據庫基因的啟動子區(Arraystar RefSeq Promoter Array)或是所有非編碼RNA的啟動子區(Arraystar ncRNA Promoter Array),能夠滿足不同客戶的需求。180 K的芯片,啟動子的覆蓋范圍近2kb,并覆蓋了幾乎所有啟動子區附近的CpG島,是一款高品質高性價比的甲基化芯片產品。

    Arraystar Human ncRNA Promoter Microarray
    Arraystar Mouse ncRNA Promoter Microarray


      (2)LncRNA與代謝及心腦血管疾病:

    心腦血管疾病以及相關的代謝疾病是一類嚴重威脅現代人身體健康的疾病。利用細胞、血管、血漿等臨床常見樣本,研究者使用Arraystar LncRNA芯片對這類疾病進行開拓性的研究。

    Circulation Research最新發表應用Arraystar LncRNA芯片研究循環性生物標記物的文章
    Cell子刊最新發表應用Arraystar LncRNA芯片研究代謝相關文章
    Diabetologia最新發表應用Arraystar LncRNA芯片研究Ⅰ型糖尿病的文章 New!
    ATVB:應用Arraystar lncRNA芯片于動脈粥樣硬化研究 New!


       
      LncPath™ 疾病/信號通路特異性 LncRNA 芯片

    迄今為止,研究得比較透徹的lncRNA還很少,超過99%的lncRNA的功能和調控機制尚不清楚。為了促進lncRNA的研究,Arraystar公司開發了LncPath™ 疾病/信號通路特異性LncRNA芯片。LncPath™ 芯片可以同時檢測與特定疾病或信號通路相關的lncRNA以及相應的靶基因,幫助客戶快速的將lncRNA的調控機制與其在特定的信號通路或疾病中的生物學功能聯系起來。

    LncPath™ 疾病/信號通路特異性LncRNA芯片列表 

    疾病:

    癌癥
    (HumanMouse)

    心血管疾病
    (HumanMouse)

    神經退行性疾病
    (HumanMouse)

     

    信號通路:

    血管生成信號通路
    (HumanMouse)

    細胞凋亡信號通路
    (HumanMouse)

    Wnt 信號通路
    (HumanMouse)

    表觀遺傳信號通路
    (HumanMouse)

    Hedgehog 信號通路
    (HumanMouse)

    Hippo信號通路
    (HumanMouse)

    代謝信號通路
    (HumanMouse)

    凋亡性壞死信號通路
    (HumanMouse)

    上皮間質轉化(EMT)信號通路
    (HumanMouse)


      (3)LncRNA與其他疾病:

           利用不同疾病的臨床樣本,研究者使用Arraystar LncRNA芯片篩查出疾病特征性lncRNA表達譜變化,提示lncRNA具有廣泛而重要的臨床應用價值,為lncRNA的深入研究提供了強有力的臨床依據。
    Cell子刊最新發表應用Arraystar LncRNA芯片研究宿主抗病毒反應的文章
    Arthritis & Rheumatism發表應用Arraystar LncRNA芯片研究骨關節炎的文章
    Int J Biochem & Cell Biol發表應用Arraystar LncRNA芯片研究囊性纖維化的文章


      (4)LncRNA與生殖、發育、再生:

           LncRNA還廣泛參與生物體的生長發育、生殖健康、組織再生等基本生物學過程。針對不同時間點的Arraystar LncRNA芯片結果,研究者可以深入探討生物生長發育等過程中的lncRNA表達譜變化,并進一步揭示lncRNA的重要功能。
    BIOLOGY OF REPRODUCTION發表應用Arraystar LncRNA芯片研究雄性生殖文章
    Plos One發表應用Arraystar LncRNA芯片研究先兆子癇的文章
    Hepatology最新發表應用Arraystar LncRNA芯片研究肝再生的文章
      (5)LncRNA與藥物:

           藥物相關的lncRNA研究是一類極為重要、具有重大應用價值的研究方向。利用Arraystar LncRNA芯片,研究者可以對藥物的藥理、毒理、成癮性、安全評估等方面進行系統而全面的分析,為人類的健康提供可靠保證。
    川大生物治療國家實驗室應用LncRNA芯片解析可卡因成癮機制
    Biochemical Pharmacology發表應用Arraystar LncRNA芯片揭示TSA抗癌機制






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