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    Arraystar lncRNA芯片應用于動脈粥樣硬化研究

    【字體: 時間:2016年05月19日 來源:康成生物

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      動脈粥樣硬化是一種脂質代謝與炎癥性血管病變,是引起心腦血管時間的常見疾病。來自廣州南方醫院的研究者發現動脈粥樣硬化新的分子機制,解釋了斑塊形成過程中非編碼RNA RP5-833A20.1如何通過microRNA和轉錄因子調控了炎癥因子以及細胞內的脂肪運輸過程,有可能對疾病治療產生重要影響。

      

    動脈粥樣硬化是一種脂質代謝與炎癥性血管病變,是引起心腦血管時間的常見疾病。來自廣州南方醫院的研究者發現動脈粥樣硬化新的分子機制,解釋了斑塊形成過程中非編碼RNA RP5-833A20.1如何通過microRNA和轉錄因子調控了炎癥因子以及細胞內的脂肪運輸過程,有可能對疾病治療產生重要影響。文章發表在2015年《Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology》 (影響因子6.0)。(芯片實驗由康成提供技術服務

    研究背景

    動脈粥樣硬化斑塊的形成與血管內皮細胞,血管平滑肌細胞以及巨噬細胞有關。巨噬細胞吞噬大量氧化型低密度脂蛋白膽固醇,導致細胞內脂質堆積,形成泡沫細胞從而促發了動脈粥樣硬化的炎癥反應;構成脂質核心和動脈粥樣硬化病變。lncRNA的研究得到了世界范圍的關注。此前雖然有發現心血管相關lncRNA的報道,然而數目有限,該領域還有廣闊的研究空間。

    研究思路

    該研究利用THP-1巨噬細胞和THP-1來源的泡沫細胞進行比較,找到100個差異表達的lncRNA,63個mRNA分子(差異倍數大于3,p值小于0.01)。通路網絡分析表明差異表達的基因參與動脈粥樣硬化,G蛋白耦聯受體等重要通路。從差異表達的分子中選擇與疾病相關的轉錄因子NFIA以及位于其內含子中的lncRNA RP5-833A20.1進行深入研究。

    過表達和干擾實驗證明lncRNA RP5-833A20.1對NFIA具有負調控作用。分子機制實驗中發現mir-382-5p可結合NFIA的3’ UTR區域抑制NFIA的 表達,而RP5-833A20.1參與了mir-382-5p的成熟加工過程。體外細胞實驗證明RP5-833A20.1/mir-382-5p/NFIA通路調控了炎癥細胞因子的表達以及細胞內的脂肪聚集;小鼠活體實驗發現NFIA過表達顯著抑制斑塊的形成,降低循環系統中的炎癥因子濃度,促進膽固醇代謝的作用,是可能的動脈粥樣硬化治療靶點。
     
    研究路線

    結果展示


     
    圖一: 左圖:聚類圖展示差異表達的lncRNA及mRNA。右圖: lncRNA RP5-833A20.1位于NFIA mRNA內含子中。

    圖二: 在THP1巨噬細胞中加入乙酰低密度脂蛋白(Ac-LDL)或氧化低密度脂蛋白(Ox-LDL),檢測lncRNA RP5-833A20.1以及NFIA在不同劑量和時間點表達量的變化。lncRNA RP5-833A20.1表達量隨劑量(a)和加藥)時間(b)遞增;NFIA mRNA表達量隨劑量(c)和加藥時間(d)遞減。

    研究意義

    該研究從疾病細胞模型出發,通過芯片篩選以及基因組注釋信息找到重要的lncRNA分子和它的靶標,以microRNA為媒介串聯成一條完整的通路。體外及體內實驗設計系統和完整,找到了關鍵的治療靶點。為的心血管疾病lncRNA研究開拓了研究思路。

    作者簡介

    王前:南方醫科大學教授,博士生導師,主任醫師。主要研究方向為快速檢驗的分子生物學、循證檢驗醫學等。建成南方醫院臨床快速檢驗實驗室,逐漸形成“重要疾病快速檢驗診斷方法學研究”、“個體化治療相關分子診斷”和“人體生物組織工程研究”等研究方向,在國內檢驗界具有較高知名度。近四年主持國家及省部級科研課題6項,主編專著及教材3部,副主編1部,發表研究論著近百篇,

    原文出處
    RP5-833A20.1/miR-382-5p/NFIA–Dependent Signal Transduction Pathway Contributes to the Regulation of Cholesterol Homeostasis and Inflammatory Reaction. Arteriosclerosis, Thrombosis, and Vascular Biology. 2015.

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