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    蛋白質印跡手冊23:故障排查(下)[創新技巧]

    【字體: 時間:2014年09月12日 來源:默克密理博

    編輯推薦:

      蛋白質印跡出了問題?沒關系,下面的troubleshooting指南一定能幫助你找出可能的原因,并為你提供補救辦法。

    3. 蛋白質觀察

    癥狀

    可能的原因

    補救辦法

    透照法檢測不佳

    膜不合適

    透照法最適合Immobilon®-P轉印膜。不建議使用硝酸纖維素或Immobilon®-PSQ轉印膜。

    在用甲醇潤濕前,膜未徹底干燥

    確保膜在轉印后徹底干燥,才浸入20%的甲醇溶液中。一定要使用20%的甲醇溶液。

    印跡只用水飽和

    20%甲醇飽和印跡。

    印跡不夠飽和

    將甲醇濃度提高到最多40%

    染色弱或不均勻

    膜在染色前未用甲醇潤濕

    膜必須用甲醇預潤濕;整張膜應均勻地從不透明變為半透明。

    不均勻/有污點的結果

    使用足夠量的孵育溶液,并確保孵育過程中膜被這些溶液完全覆蓋

    所使用的容器應足夠大,讓溶液在印跡上自由移動。每次切勿在同一個容器中孵育超過一張印跡。此外,印跡的蛋白質一側應朝上,這樣就不會與容器的底面相互作用。

    氣泡

    印跡的表面不應有任何氣泡。沿容器邊緣輕拉膜,以趕走氣泡。

    試劑質量不佳

    所有的緩沖液和試劑應當是新鮮的,不含顆粒和污染物。使用Millex® 針頭式過濾器或Stericup®Steritop® Steriflip®過濾裝置來過濾緩沖液,抗體儲液可能需要離心。

    背景染色高

    蛋白質與膜的非特異性結合

    確保使用干凈的電轉移設備和組件,以及高質量的試劑和Milli-Q® 水。

    4. 免疫檢測

    癥狀

    可能的原因

    補救辦法

    信號弱

    封閉試劑不適當

    封閉劑可能對目的蛋白有親和力,從而掩蓋了蛋白,影響檢測。嘗試不同的封閉劑和/或降低封閉劑的量或暴露時間。

    抗體孵育時間不夠

    增加孵育時間。

    抗體濃度太低,或抗體無活性

    抗體溶液的反復凍融或細菌污染可能改變抗體的滴度或活性。提高抗體濃度或新鮮制備。

    檢測試劑過期

    使用新鮮的底物并適當保存。過期的底物會降低靈敏度。

    蛋白質轉印的問題

    優化蛋白質轉印(見上文)。

    顯色檢測中的印跡干燥

    如果使用顯色檢測系統,對比度不佳,那么印跡可能已干燥。嘗試用水重新潤濕印跡,以便最大限度提高對比度。

    自來水讓顯色檢測試劑失活

    在準備試劑時使用Milli-Q® 水。

    疊氮化物抑制HRP

    請勿在封閉液中使用疊氮化物。

    抗原濃度太低

    轉印之間在凝膠中上樣更多的抗原。

    無信號

    抗體濃度太低

    增加一抗和二抗的濃度。

    HRP抑制

    HRP標記的抗體不應使用在包含疊氮化鈉的溶液中。

    一抗是針對天然蛋白的

    在非變性凝膠中分離蛋白質,或使用針對變性抗原的抗體。

    不均勻的印跡

    印跡上出現指紋、折痕或鑷子痕跡

    不要觸摸或折疊膜;使用手套和鈍端鑷子。

    有污點的背景

    封閉試劑中有結塊

    通過0.2 μm0.45 μmMillex® 針頭式過濾器裝置來過濾封閉液。

    HRP標記的二抗中有聚集物

    通過0.2 μm0.45 μmMillex® 針頭式過濾器裝置來過濾二抗溶液。

    背景高

    清洗不夠

    增加清洗量和次數。利用Millex® 針頭式過濾器或Steriflip®過濾裝置來預過濾所有溶液,包括轉印緩沖液。

    二抗(酶結合)抗體濃度過高

    增加抗體稀釋度。

    蛋白質之間相互作用

    在清洗和檢測溶液中使用吐溫200.05%),以減少蛋白質之間相互作用,并提高信噪比。

    Immobilon®-PSQ轉印膜上的免疫檢測

    增加封閉液的濃度或量,以補償更大的膜表面積。在清洗緩沖液中加入最多0.5 M NaCl0.2% SDS,并將清洗時間延長至2小時,可減少頑固的背景。

    試劑質量不佳

    使用高質量的試劑和Milli-Q® 水。

    封閉液和抗體之間的交叉反應性

    使用不同的封閉液或在清洗液中加入吐溫20去污劑。

    膠片曝光過度

    縮短曝光時間。

    孵育過程中膜變干

    在孵育過程中使用足量溶液,以覆蓋膜。

    抗體質量不佳

    使用高親和力的純化抗體。

    檢測試劑過量

    在曝光前徹底排干印跡。

    頑固背景

    非特異性的結合

    使用高鹽清洗。(操作3.4,第54頁)

    癥狀

    可能的原因

    補救辦法

    背景高(快速免疫檢測)

    在快速免疫檢測過程中膜濕透

    減少抗體稀釋液中的吐溫20< 0.04%)去污劑。

    在孵育過程中輕柔搖動。

    在電轉移之后用Milli-Q® 水沖洗印跡,以去除凝膠上殘留的SDS。在開始任何檢測操作之前,確保印跡徹底干燥。

    免疫檢測之前膜用甲醇潤濕

    切勿預潤濕膜。

    免疫檢測之前膜未徹底干燥

    確保膜已徹底干燥,再開始檢測。

    非特異結合

    一抗濃度過高

    增加一抗稀釋度。

    二抗濃度過高

    增加二抗稀釋度。

    抗原濃度過高

    降低凝膠上蛋白的上樣量。

    膠片上圖像倒轉(黑色背景上出現白色條帶

    太多HRP結合的二抗

    降低HRP結合的二抗濃度。

    小蛋白的檢測不佳

    小蛋白被大的封閉分子(如BSA)所遮蔽

    考慮使用酪蛋白或低分子量的聚乙烯吡咯烷酮(PVP)。

    表面活性劑,如吐溫和Triton® X-100應減少。

    避免用抗體和清洗液孵育過長時間。

    5. 熒光檢測

    癥狀

    可能的原因

    補救辦法

    整體背景高

    印跡膜的背景熒光高

    使用Immobilon®-FL轉印膜。

    封閉試劑未針對熒光檢測而優化

    使用Bløk®-FL Noise-canceling試劑,為熒光Western印跡而優化。

    多重分析的問題

    實驗設計

    兩個抗體必須來自不同的宿主物種,這樣它們才能被不同特異性的二抗所區分。在使用兩個一抗之前,需要分別在單獨的印跡上檢測條帶模式,以確定條帶出現的位置。在雙色檢測中應使用交叉吸附過的二抗。

    背景有污點

    處理印跡時有灰塵/粉末顆粒

    戴上無粉塵手套處理印跡,并清潔掃描儀的表面。

    信號低

    濕的印跡

    干燥印跡可提高信號強度。印跡可重新潤濕后再掃描。在掃描時切勿用保鮮膜或Saran™膜包住印跡。

    印跡光漂白

    盡管熒光染料通常能提供持久的穩定信號,但一些熒光染料會很容易發生光漂白。為了防止光漂白,在二抗孵育和清洗時應保持讓膜避光,直至準備進行掃描。將顯像好的印跡保存在暗處,以便后續成像。

    錯誤的激發波長

    在印跡成像或使用發射濾光片時遵照染料制造商的使用說明。

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