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    PNAS:lncRNA可作為白血病預后標志物

    【字體: 時間:2014年12月17日 來源:生物通

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      最近,美國俄亥俄州立大學綜合癌癥中心- Arthur G. James腫瘤醫院和Richard J. Solove研究所(OSUCCC - James)研究人員帶領的一項新研究,描述了一種新的標志物,可能幫助醫生為許多急性髓細胞白血病(AML)老年患者選擇毒性最小、最有效的治療方法。相關研究結果發表在最近的《PNAS》雜志。

      

    生物通報道:最近,美國俄亥俄州立大學綜合癌癥中心- Arthur G. James腫瘤醫院和Richard J. Solove研究所(OSUCCC - James)研究人員帶領的一項新研究,描述了一種新的標志物,可能幫助醫生為許多急性髓細胞白血。ˋML)老年患者選擇毒性最小、最有效的治療方法。AML好發于老年人,中位發病,年齡為65~70歲,35%新診斷的AML患者年齡≥75歲,三年的生存率為5%到15%。

    研究人員研究了稱為長非編碼RNAs(lncRNAs)的分子的模式,這類RNA分子長度超過200個核苷酸單位,參與基因的調節。研究人員在60歲及以上患有細胞遺傳學正常(CN)AML的老年患者中,檢測了lncRNAs的豐度或表達。相關研究結果發表在最近的《PNAS》雜志。

    本文第一作者、俄亥俄州立大學內科學副教授Ramiro Garzon博士指出:“我們已經確認了48個lncRNAs的模式,可預測老年CN-AML患者對標準化療的反應和總生存率!

    他說:“在良好組中的患者,對標準化療反應的概率較高,而在不利組中的患者,一般對治療的反應不佳,具有較差的整體生存率!

    本研究首席研究員、俄亥俄州立大學特聘教授Clara D. Bloomfield博士說,這些結果非常重要,有幾個原因。“首先,它們強烈表明,lncRNA表達譜可以預測哪些患者會對標準治療有反應。這很重要,因為它可使患者免受實驗性療法的毒副作用!

    “被分在不利組中的患者,將接受不同的療法,干細胞移植或用新治療方法的一個臨床試驗。因此,本研究將幫助我們為每名患者定制白血病療法。”此外,她說,這項研究為新療法的開發確定了很多新靶點。

    Garzon、Bloomfield及其同事們,利用來自Cancer and Leukemia Group B 臨床試驗的148名老年CN-AML患者的骨髓樣本,開發了一種預后評分系統。所有患者都接受了相同的化療方案。

    研究人員首先確定了與預后最相關的48個lncRNAs。利用這48個lncRNAs,研究人員將患者分為兩組:具有良好預后得分和具有不好預后得分的患者。然后,研究人員在71名接受同樣治療的CN-AML患者獨立匹配組中,驗證了預后得分。

    將具有不利預后得分的患者與具有良好得分的患者進行對比,顯示如下:
    • 具有不利分得分的患者,具有較低的完全反應(CR)率(分別為54%和89%);
    • CR三年后,具有不利分得分的患者當中,只有7%的人完全擺脫了疾病,而具有良好分值的患者中,這個值是39%。
    • 具有不利得分的這些患者,三年的總生存率是10%,而具有良好得分的患者為43%。
    • 獨特的lncRNA表達譜與6個臨床上重要的CN-AML突變有關。

    總而言之,研究人員發現,lncRNA表達譜與AML的復發性突變、臨床特征和預后有關。這些lncRNAs的一部分,可能在白血病生成中起著功能性作用。此外,lncRNAs可以用作AML預后的生物標志物。

    (生物通:王英)

    延伸閱讀:《相約2015NSFC》之疾病相關lncRNA研究策略

    生物通推薦原文摘要:
    Expression and prognostic impact of lncRNAs in acute myeloid leukemia
    Abstract: Long noncoding RNAs (lncRNAs) are transcripts longer than 200 nucleotides, located within the intergenic stretches or overlapping antisense transcripts of protein coding genes. LncRNAs are involved in numerous biological roles including imprinting, epigenetic regulation, apoptosis, and cell cycle. To determine whether lncRNAs are associated with clinical features and recurrent mutations in older patients (aged ≥60 y) with cytogenetically normal (CN) acute myeloid leukemia (AML), we evaluated lncRNA expression in 148 untreated older CN-AML cases using a custom microarray platform. An independent set of 71 untreated older patients with CN-AML was used to validate the outcome scores using RNA sequencing. Distinctive lncRNA profiles were found associated with selected mutations, such as internal tandem duplications in the FLT3 gene (FLT3-ITD) and mutations in the NPM1, CEBPA, IDH2, ASXL1, and RUNX1 genes. Using the lncRNAs most associated with event-free survival in a training cohort of 148 older patients with CN-AML, we derived a lncRNA score composed of 48 lncRNAs. Patients with an unfavorable compared with favorable lncRNA score had a lower complete response (CR) rate [P < 0.001, odds ratio = 0.14, 54% vs. 89%], shorter disease-free survival (DFS) [P < 0.001, hazard ratio (HR) = 2.88] and overall survival (OS) (P < 0.001, HR = 2.95). The validation set analyses confirmed these results (CR, P = 0.03; DFS, P = 0.009; OS, P = 0.009). Multivariable analyses for CR, DFS, and OS identified the lncRNA score as an independent marker for outcome. In conclusion, lncRNA expression in AML is closely associated with recurrent mutations. A small subset of lncRNAs is correlated strongly with treatment response and survival.


     

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