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    PacBio重磅推出Kinnex系列試劑盒

    【字體: 時間:2023年12月20日 來源:基因有限公司

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      基于Kinnex試劑盒,您可以高度準確地預測蛋白質,識別異構體,表征剪接事件,把單細胞UMI和barcode 追溯回特定細胞,以及實現種水平的微生物群落分析。

    Kinnex試劑盒采用MAS-Seq串聯的方式,通過將短的全長cDNA或全長16S擴增子串聯成一個長文庫,可大幅提高PacBio長讀長測序系統的通量。Kinnex試劑盒包括Kinnex 全長RNA試劑盒、Kinnex單細胞RNA試劑盒以及Kinnex全長16S rRNA試劑盒三種。基于Kinnex試劑盒,您可以高度準確地預測蛋白質,識別異構體,表征剪接事件,把單細胞UMI和barcode 追溯回特定細胞,以及實現種水平的微生物群落分析。

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    Kinnex試劑盒可用于:

    1. 基于Iso-Seq的全長RNA測序

    傳統的RNA-Seq將cDNA片段化后用于短讀長測序(100-200 bp),必須通過算法來推斷原始的轉錄本異構體。然而,由于可變剪切事件的復雜性,許多異構體具有高度相似的結構,推斷出的轉錄本不準確。PacBio HiFi的Iso-Seq可對全長RNA異構體進行測序,無需進行cDNA片段化和轉錄本組裝,能夠準確檢測全長異構體。

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    PacBio Kinnex全長RNA試劑盒

    以總RNA作為起始樣本,輸出一個可直接用于測序的文庫,您可以實現:

    • 與典型的Iso-Seq文庫相比,其通量提高了8倍。

    • 從5'端到3'端全長異構體測序; 

    • 準確表征剪接位點; 

    • 可發現新基因和新異構體,鑒定融合基因;

    • 獲得異構體read計數信息。

    2. 單細胞RNA測序

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    PacBio Kinnex單細胞RNA試劑盒處理單細胞cDNA可以得到一個可用于HiFi測序的文庫,您可以實現:

    • 支持10x Chromium單細胞3'試劑盒(v3.1)和5'試劑盒(v2)產生的cDNA;

    • 與常規單細胞Iso-Seq文庫相比,單細胞MAS-Seq文庫可使通量提高16倍;

    • 獲得基因表達及全長isoform信息,更好地識別轉錄起始位點(TSS)和多聚腺苷酸化(polyA)位點;

    • 在單細胞水平上揭示RNA異構體多樣性,有助于發現新的異構體;

    • 檢測癌癥中的表達突變和融合轉錄本。

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    3. 全長16S擴增子測序

    全長16S擴增子測序為可培養以及難培養的微生物基因組研究提供了更全面和更高質量的數據:

    • 減少序列相似性,檢測更多的核苷酸差異,以獲得更好的分類分辨率區分關鍵物種和菌株;

    • 揭示樣本的真正多樣性。

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    PacBio Kinnex 16S rRNA試劑盒在保持菌種水平分辨率的基礎上,用MAS-Seq方法提高了PacBio長讀長測序儀的通量,您可以進一步實現:

    • 通量提高12倍,更具性價比;

    • 獲得更高分辨率和更高質量的全長16S分析。

    是什么讓Kinnex與眾不同?

    成本效益+創新技術:基于現有的PacBio測序方法,Kinnex試劑盒允許將短片段(cDNA/16S rRNA)連接成長片段文庫,優化HiFi測序,提升性價比。

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    基因有限公司作為PacBio公司中國區合作伙伴,自2011年以來將PacBio第三代單分子實時測序技術引入國內,一直為國內用戶提供專業的三代測序系統的安裝培訓,技術支持,應用培訓與售后維護工作,贏得客戶的一致好評與信任。基因有限公司將一如既往的支持越來越多的PacBio用戶。


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