Element Biosciences公司近日發布了他們的第一款測序儀——Element AVITI系統，這是一款臺式測序儀，能夠提供出色的性能、更低的成本和更高的靈活性。

據悉，Element專有的Avidity短讀長測序試劑能夠帶來其他臺式系統無法比擬的準確性和成本效益。AVITI系統可獨立運行兩個流動槽，為用戶帶來極大的靈活性。AVITI操作軟件也具有可調節讀取通量的功能，在運行時間方面帶來了更多的靈活性。

AVITI系統的主要參數如下：

▪ 2x150 bp雙端讀長
▪ 2x150 bp讀長下的Q30 > 90%
▪ 每個流動槽可產生800M+雙端reads
▪ 每個流動槽可產生240 Gb數據
▪ 2個隨機存取流動槽，總共可產生480 Gb數據
▪ 13-48個小時的運行時間
▪ 每Gb成本5-7美元（由流動槽產量決定）

首席技術官Michael Previte在發布會上談到了Element是如何不斷改進的，其重點在于最大化信噪比：讓信號最大化，同時讓背景最小化。他還強調了兩個獨立流動槽帶來的靈活性，認為“它本質上是一臺儀器內有兩個測序系統，你可以啟動一側的流動槽，然后待會兒回來再啟動另一個。”Previte還表示，該系統未檢測出標簽跳躍（index hopping）。

同時，Element還與NGS文庫制備和生物信息學領域的多家公司合作，包括安捷倫、QIAGEN、NEB、羅氏、10x Genomics等。這些被稱為創新合作伙伴的早期客戶將獲得2個免費的試劑盒和一年額外保修。

Element Biosciences公司的首席執行官兼聯合創始人Molly He表示：“隨著AVITI系統的推出，Element正在實現其愿景，即普及高質量、低成本且易用的基因組學工具。通過最近對Loop Genomics的收購，我們將在一個平臺上同時提供短讀長和長讀長測序功能。AVITI將為用戶帶來前所未有的自由度和靈活性。”

今年2月，Element Biosciences宣布已完成對Loop Genomics的收購。通過將Element的高精度短讀長測序平臺與Loop的簡單且可擴展的長讀長解決方案相結合，客戶將能夠在同一平臺上實現短讀長和長讀長應用。

Loop Genomics的創始人Tuval Ben-Yehezkel現已加入Element Biosciences。他解釋了如何利用短讀長測序儀來實現長讀長測序，以解決定相問題。主要是在樣本上添加獨特分子標識符（UMI），以了解哪些變異與同一條核酸鏈相關聯。在測序獲得短讀長后，通過軟件重新組裝，然后推斷原始的長序列，也就是“合成長讀長”。

剛剛加入Element并擔任應用和科學事務高級副總裁的Shawn Levy表示：“在Beta測試中，文庫兼容性和測序性能都和我們預期的一樣好。采用AVITI系統的用戶可對工作流程和數據質量充滿信心。”Levy之前曾在Hudson Alpha研究所參與AVITI系統的測試工作。

Element目前已發布了七份應用指南和技術指南，以及五個可供下載的測序數據集，覆蓋人類全基因組、細菌全基因組和RNA-seq分析。公司現已開始接受AVITI系統的訂單，預計從2022年第二季度開始發貨。

AVITI測序儀的定價為28.9萬美元。不過，Molly He表示他們可能會提供批發價。“我們正在考慮基于數量的折扣。這將是透明的。”