R-loop是由轉錄的RNA鏈與打開的雙鏈DNA其中一條鏈發生堿基互補配對，形成RNA-DNA雜合鏈，同時使未配對的另一條DNA鏈游離在外組成的三方結構。R-loop分布廣泛，占哺乳動物基因組的 5%，經常出現在基因組的啟動子CGI和轉錄終止位點。已有研究表明，R-loop在調節基因表達、DNA 復制以及 DNA 和組蛋白修飾等方面均發揮著重要作用，具有重要的生物學功能。

Nat Genetics (IF 38.33): Antisense lncRNA通過形成R-loop影響coding RNA轉錄

Antisense lncRNA是與coding RNA轉錄方向相反，轉錄位置部分重合的長鏈非編碼RNA，通常可以順式調控臨近coding RNA的轉錄。2019年Nature Genetics發表的文章發現，antisense lncRNA TARID通過形成R-loop影響臨近coding RNA TCF21啟動子去甲基化，進而調控TCF21表達和癌癥進程。

TCF21是與一種抑癌基因，在多種癌癥中表達下調，它具有頭對頭反義lncRNA TARID（TCF21 antisense RNA inducing demethylation）。TARID轉錄過程會在TCF21啟動子附近形成R-loop，被R-loop識別蛋白GADD45a結合，GADD45a進而招募去甲基化酶TET1，促進DNA去甲基化來增強TCF21轉錄，影響細胞周期。

Antisense lncRNA TARID通過形成R-loop調控TCF21啟動子DNA去甲基化及轉錄

DRIP-seq全新發布！

DRIP-seq（DNA:RNA hybrid immunoprecipitation and sequencing）利用特異性識別DNA:RNA雜合鏈的S9.6抗體對包含R-loop結構的 DNA 鏈進行富集，后續通過DNA測序來實現 R-loop分析，側重于通過NGS在基因組水平上檢測R-loops結構的分布，并通過生物信息學分析在不同的領域從中挖掘出更多有用的信息。

DRIP-seq優勢

▪ 嚴格的質控體系：設置陰性對照組和陽參，以控制文庫質量。
▪ 穩定性高：實驗操作穩定性高，減少實驗操作帶來的誤差。
▪ 靈活度高：能夠直接對有基因組信息的物種進行R-loop測序。
▪ 提供數據可視化，豐富的注釋信息與文章發表級別的圖譜

康成生物/數譜生物全新推出DRIP-Seq技術服務！歡迎了解更多：www.aksomics.com，或撥打數譜生物熱線400-886-5058/021-64451989