
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳動的脈搏
使用分子標(biāo)簽(UMT)對單個分子進行準(zhǔn)確分析:ThruPLEX® Tag-seq Kit
【字體: 大 中 小 】 時間:2017年12月12日 來源:Takara
編輯推薦:
通過帶有特別分子標(biāo)簽(UMT)的引物,構(gòu)建帶有分子標(biāo)記和樣品檢索引物的NGS文庫。包含超過1,600萬個特別序列用于在擴增前標(biāo)記每條DNA片段,以檢測低豐度等位基因或計數(shù)獨立片段。
ThruPLEX Tag-seq Kit 基于新的ThruPLEX技術(shù),采用帶有特別分子標(biāo)簽(UMT)的ThruPLEX引物構(gòu)建帶有分子標(biāo)記和樣品檢索引物的Illumina NGS文庫。每個試劑盒包含超過1,600萬個特別序列用于在擴增前標(biāo)記每條DNA片段,可以在文庫制備、目標(biāo)富集和數(shù)據(jù)分析過程中追蹤DNA片段,以檢測低豐度等位基因或計數(shù)獨立片段。
ThruPLEX Tag-seq采用ThruPLEX 技術(shù)設(shè)計及優(yōu)化,可以1到50 ng DNA起始構(gòu)建高多樣性、高重復(fù)性文庫。整個流程在單管或單孔中就可完成,只需3步,2小時,無需中間純化步驟和樣品轉(zhuǎn)移,避免了操作誤差和樣品損失。ThruPLEX Tag-seq Kit 包含所需全部試劑,包括可以多重標(biāo)記96個樣品的檢索引物。純化和定量后,文庫可以采用標(biāo)準(zhǔn)Illumina測序試劑和流程在Illumina NGS平臺進行測序。同時采用Curio Genomics提供的云服務(wù)軟件或開源軟件進行生物信息學(xué)分析,從而快速獲得研究結(jié)果。
ThruPLEX Tag-seq兼容主流平臺實現(xiàn)強有力的目標(biāo)區(qū)域富集,如Agilent SureSelect® and Roche NimbleGen SeqCap® EZ。


圖1: ThruPLEX Tag-seq技術(shù)流程

圖2:使用本kit 對30 ng 1% Horizon cfDNA standard,采用 ThruPLEX Tag-seq構(gòu)建文庫。Agilent SureSelect富集目標(biāo)區(qū)域,~5,000X覆蓋度測序,采用Curio Genomics生物信息學(xué)平臺分析數(shù)據(jù)。采用原始數(shù)據(jù)分析,EGFR 的突變(黃色點)會被背景誤差遮蓋(左圖)。而在數(shù)據(jù)分析過程中使用UMT修正誤差,突變更容易識別(右圖)。

圖3:使用本kit 對30 ng(A)或10 ng Horizon cfDNA standard采用ThruPLEX Tag-seq構(gòu)建文庫,240 KB定制panel(NimbleGen SeqCapEZ)富集目標(biāo)區(qū)域,HiSeq 2500 ~5,000X覆蓋度測序。Curio Genomics生物信息學(xué)分析平臺進行數(shù)據(jù)分析。
*數(shù)據(jù)來源于Takara Bio Inc.