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不讓Western blot得白板,V3拯救你[新品推薦]
【字體: 大 中 小 】 時間:2015年01月21日 來源:生物通
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Bio-Rad的V3 Western流程是在傳統的Western流程中引入了創新的免染(Stain-Free)技術。操作過程并沒有什么變化,但能夠大大縮短整個實驗的時間。同時,免染技術讓研究人員能看到凝膠和轉印膜上的蛋白質,而無需染色,也不會影響免疫檢測中的抗體雜交。
Western blot實驗的失敗,那都是家常便飯。據Bio-Rad統計,大約一半的研究人員表示,他們Western blot的失敗率至少在25%。如此高的失敗率,難怪會讓人心慌慌。況且整個實驗流程那么長,辛苦一整天,得到一張“白板”,還真是有點不甘心。
其實,我們會如此焦慮,是因為實驗過程中幾乎沒什么機會來檢查結果是否和預期的一致。我們只能通過預染marker來了解大致情況。如果在Western blot流程中加入檢查點,確保每一步都獲得可靠的結果,那勢必能減輕研究人員的焦慮。基于這一考慮,Bio-Rad推出了V3 Western Workflow。
這個V3流程是在傳統的Western流程中引入了創新的免染(Stain-Free)技術。操作過程并沒有什么變化,但能夠大大縮短整個實驗的時間。同時,免染技術讓研究人員能看到凝膠和轉印膜上的蛋白質,而無需染色,也不會影響免疫檢測中的抗體雜交。
V3,這代表什么?據Bio-Rad介紹,V3即V+V+V,但這三個V有著不同的涵義。第一個V代表Visualize。在電泳結束后將凝膠放入Bio-Rad的成像系統中1分鐘激活成像,即可得到一張類似于考馬斯藍染色的圖像,從而判斷分離效果。第二個V是Verify。在轉印結束后,通過成像系統可以看到印跡膜上的蛋白,從而判斷轉印的效率。至于第三個V,就是Validate,利用膜上的總蛋白作為內參來進行定量歸一化。
加州大學戴維斯分校的助理教授Aldrin Gomes認為,這些檢查點的確很有用。“我們能夠對凝膠成像,而無需外部染料,并快速確定凝膠上的樣品是否有問題。在轉印之后,我們同樣對凝膠成像,如果任何一步有問題,我們就停下來。”這個停下來,不僅節約了抗體和時間,也是為了總結經驗教訓后再出發。

V3 Western 流程總共包含五步:
1. 蛋白電泳。利用Mini-PROTEAN® TGX Stain-Free預制膠或Criterion™ TGX Stain-Free預制膠,以及標準的Tris/甘氨酸緩沖液,快速分離蛋白質。TGX Stain-Free預制膠采用一種獨特的配方,能夠在15分鐘內快速分離蛋白質。
2. 觀察分離。通過免染技術,將凝膠放入ChemiDoc Touch或ChemiDoc™ MP成像系統中激活1分鐘,即可觀察蛋白分離。此技術的原理是將蛋白膠浸泡在三氯乙酸或氯仿中,然后通過紫外光照射。在三氯化合物存在時,紫外光驅使色氨酸發生反應,產物會發出可見區內的光,從而實現蛋白條帶在膠上的定位。這樣無需染色,也能對蛋白分離的情況了如指掌。
3. 蛋白轉印。利用TransBlot Turbo轉印系統和TGX Stain-Free預制膠,最快3分鐘即可完成轉印。TransBlot Turbo,又稱為全能型蛋白轉印系統,一次可轉印4塊mini膠或2塊midi膠。它采用了一種新配方的轉印緩沖液,并使用了一種特殊材質的濾紙。這種組合能夠承受更大電流,使轉印不僅更快,而且更完全。
4. 轉印驗證。同樣,利用ChemiDoc Touch或ChemiDoc MP成像系統,能夠對PVDF或NC膜上的蛋白進行觀察,即時檢查蛋白轉印的效果,而不需要麗春紅染色。如果轉印有問題,那么后續就不需要浪費寶貴的一抗了。
5. Western blot驗證。實驗當然少不了參照。過去的Western blot實驗通常以看家基因作為內參,來確定蛋白質的相對表達量。然而,研究也發現,這些蛋白在病變組織與正常組織間、不同的正常組織間以及同一組織的不同部位都呈現出差異表達。因此,如今人們傾向于選擇總蛋白作為內參。利用ChemiDoc Touch或ChemiDoc™ MP成像系統以及Image Lab軟件,研究人員能夠以總蛋白來進行定量歸一化,從而消除實驗誤差,得到更為可靠的結果。
V3 Western流程中有三款儀器可供選擇,包括ChemiDoc Touch、ChemiDoc MP和Gel Doc EZ系統。其中,ChemiDoc Touch是去年底上市的新產品。它采用創新的鏡頭和光學組件、超高品質CCD,將數字成像系統的靈敏度和圖像質量真正提高到膠片級別,能產生可立即發表的圖像。如何在這三款儀器中做出選擇,請看下表。
|
成像系統 |
ChemiDoc Touch |
ChemiDoc MP |
Gel Doc EZ | |||
|
檢測類型 |
化學發光以及常規的蛋白和DNA凝膠成像 |
化學發光、多重熒光以及常規的蛋白和DNA凝膠成像 |
常規的蛋白和DNA凝膠成像 | |||
|
Western blot靈敏度 |
+++++ |
++++ |
N/A | |||
|
免染技術 |
√ |
√ |
√ | |||
|
觸摸屏/嵌入式計算機 |
√ |
x |
x | |||
|
凝膠形式 |
mini 膠 |
midi 膠 |
mini 膠 |
midi 膠 |
mini 膠 |
midi 膠 |
以往一整天才能獲得的結果,如今借助這些新穎的技術和儀器,6小時就能完成,而且不是白板哦。老板再也不用擔心我的Western blot了。(生物通 余亮)