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    新型移動HIV-DNA檢測技術

    【字體: 時間:2014年06月10日 來源:生物通

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      最近,在國際知名雜志《Analytical Chemistry》發表的一項研究中,美國萊斯大學的生物工程師們研發出一種簡單、高度精確的檢測技術,來檢測患者體內的HIV跡象及病情發展情況。

      

    生物通報道:最近,在國際知名雜志《Analytical Chemistry》發表的一項研究中,美國萊斯大學的生物工程師們研發出一種簡單、高度精確的檢測技術,來檢測患者體內的HIV跡象及病情發展情況。

    萊斯大學生物工程師、全球衛生技術學院的主任Rebecca Richards-Kortum稱,當前診斷嬰兒HIV和監測病毒載量的金標準,通常是依賴僅在診所可用的實驗室設備和專業技術。這項研究,開發出以核酸為基礎的新型HIV檢測技術,能夠在醫療保健單位進行檢測。

    本文共同第一作者是Richards-Kortum 實驗室的研究生Zachary Crannell和Brittany Rohrman,他們開展了這項概念驗證性工作,在今年早些時候,他們利用類似的技術檢測到引起腹瀉病隱孢子蟲病的寄生蟲。

    這項新型檢測技術,用基于重組酶聚合酶擴增(RPA)技術取代了基于聚合酶鏈式反應的復雜實驗室程序,RPA可以對血液中的遺傳標記物進行快速多重擴增,從而使病毒的遺傳標記物很容易地檢測到。在一個被稱為qRPA的檢測中,利用可通過輕便機器進行定量檢測的熒光探針,靶定和標記HIV DNA中的一段特定序列。最后,通過熒光DNA的軟件分析,就可使得臨床醫生以極高的準確性,來確定病毒是否存在于患者的血液內,或病毒的量是多少。

    研究人員通過放大內部陽性對照對測試進行校準。Rohrman稱:“利用跟HIV序列相同的引物擴增,因此檢測試驗可以正常進行。”研究人員最初只是打算尋找嬰兒中的HIV,但是該技術還可以幫助他們追蹤老年患者機體中的病毒載量。Crannell稱:“臨床醫生能夠實時監測患者體內的病毒載量,從而確保患者是否對治療發生反應,這非常的重要。”

    研究人員稱,為了臨床可行性,一種HIV DNA檢測能夠定量的病毒載量,必須超過四個數量級,從很高到很低。他們稱,這種新型試驗很容易滿足這個目標。

    他們正在開發用于資源匱乏地區的工具,在這些地區高科技實驗室設備無法使用。盡管研究人員使用熱循環儀來進行檢測,但他們正在研究一種技術,使得整個操作步驟維持在室溫和體溫之間,從而確保實驗的通用性和準確性。

    (生物通:王英)

    延伸閱讀:華人學者《德國應用化學》:新的HIV疫苗研制方法

    生物通推薦原文摘要:
    Quantification of HIV-1 DNA Using Real-Time Recombinase Polymerase Amplification
    Abstract: Although recombinase polymerase amplification (RPA) has many advantages for the detection of pathogenic nucleic acids in point-of-care applications, RPA has not yet been implemented to quantify sample concentration using a standard curve. Here, we describe a real-time RPA assay with an internal positive control and an algorithm that analyzes real-time fluorescence data to quantify HIV-1 DNA. We show that DNA concentration and the onset of detectable amplification are correlated by an exponential standard curve. In a set of experiments in which the standard curve and algorithm were used to analyze and quantify additional DNA samples, the algorithm predicted an average concentration within 1 order of magnitude of the correct concentration for all HIV-1 DNA concentrations tested. These results suggest that quantitative RPA (qRPA) may serve as a powerful tool for quantifying nucleic acids and may be adapted for use in single-sample point-of-care diagnostic systems.

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