生物通報道  來自凱斯西儲大學醫(yī)學院的科學家們獲得了不同尋常的雙重研究發(fā)現(xiàn)。首先，他們鑒別出了數(shù)以千計的新型長鏈非編碼核糖核酸(lncRNA)轉(zhuǎn)錄本。其次，他們了解到其中的一些lncRNAs挑戰(zhàn)了關(guān)于lncRNA轉(zhuǎn)錄本的一些傳統(tǒng)認知，證實在細胞中它們實際上引導了蛋白質(zhì)合成。兩項突破詳細地報道在6月12日的《Cell Reports》雜志上。

凱斯西儲大學醫(yī)學院RNA分子生物學中心的助理教授Kristian E. Baker博士領(lǐng)導研究小組，采用高通量的基因表達分析生成了這些令人驚嘆的研究結(jié)果，其有可能最終促成針對癌癥和某些遺傳疾病的新療法。

Baker說：“我們的研究工作確定了酵母中的一些lncRNAs可以編碼蛋白質(zhì)，我們提供的證據(jù)表明，這有可能同樣適用于包括人類在內(nèi)的哺乳動物。新研究擴展了我們對于基因組遺傳編碼潛力的認知。”

與包括凱斯西儲大學的一些研究生和大學生合作，Baker對酵母和小鼠的細胞進行了分析。由于酵母和小鼠細胞與人類細胞存在功能相似性，它們被選做為模式生物。

lncRNAs是一類轉(zhuǎn)錄長度超過200nt的RNA分子，以往lncRNAs被認為缺乏編碼蛋白質(zhì)的信息和能力，不編碼蛋白，不具有生物學功能，是基因組轉(zhuǎn)錄的“噪音”。人們由此將它們與由已知基因表達生成，主要充當?shù)鞍踪|(zhì)合成模板的mRNA區(qū)分開來。在新研究中，凱斯西儲大學的研究小組證實一組lncRNAs可被翻譯機器讀取，生成了蛋白質(zhì)產(chǎn)物（延伸閱讀：Science、EMBO重要發(fā)現(xiàn)：編碼蛋白質(zhì)的lncRNAs ）。

在未來，Baker和同事們將繼續(xù)尋找新的RNA轉(zhuǎn)錄本，并探究這些lncRNAs和它們的蛋白質(zhì)產(chǎn)物在細胞中的功能。

Baker所：“發(fā)現(xiàn)更多的轉(zhuǎn)錄本等同于發(fā)現(xiàn)了新型的基因。這項工作的意義在于，我們發(fā)現(xiàn)了一些從前未知基因的表達證據(jù)。知道一些基因被表達，是闡明它們在正常細胞功能或功能障礙及疾病中所起作用的第一步。”

（生物通：何嬙）

生物通推薦原文摘要：

Translation of Small Open Reading Frames within Unannotated RNA Transcripts in Saccharomyces cerevisiae

High-throughput gene expression analysis has revealed a plethora of previously undetected transcripts in eukaryotic cells. In this study, we investigate >1,100 unannotated transcripts in yeast predicted to lack protein-coding capacity. We show that a majority of these RNAs are enriched on polyribosomes akin to mRNAs. Ribosome profiling demonstrates that many bind translocating ribosomes within predicted open reading frames 10–96 codons in size. We validate expression of peptides encoded within a subset of these RNAs and provide evidence for conservation among yeast species. Consistent with their translation, many of these transcripts are targeted for degradation by the translation-dependent nonsense-mediated RNA decay (NMD) pathway. We identify lncRNAs that are also sensitive to NMD, indicating that translation of noncoding transcripts also occurs in mammals. These data demonstrate transcripts considered to lack coding potential are bona fide protein coding and expand the proteome of yeast and possibly other eukaryotes.