抗體藥物研發是目前藥物研究的熱點之一。在疫苗工程，治療性抗體篩選以及糖基化研究中都會有大量的蛋白樣品需要被分析。目前許多實驗室仍依賴于SDS-PAGE技術，這一方法耗時耗力不說，且通量有限，而諸如CE和HPLC等方法則無法進行高通量分析，這導致了整個研究進程無法高效運行。

為了推動這些領域研究的進程，美國Caliper公司將微流體芯片技術應用于高通量蛋白分析領域，推出了LabChip GX II生物大分子分析儀用。LC GX II自動分析系統可進行快速高效的蛋白分析。用戶只需要將待檢測的蛋白樣品放在微孔板中，微流體芯片上的單道吸樣針（sipper）會自動將樣品吸入，之后在LCGX II系統上自動進行染色、脫色、分離以及信號檢測，其配套的分析軟件可自動計算每個樣品的濃度、分子量大小、純度等。用戶還可根據需要，通過膠圖、電泳峰圖或者數據列表等方式查看數據。這使得LC GX II在疫苗開發和質量控制，抗體和 N-聚糖研究等研究領域成為理想工具。

1. 抗體質量篩選

質量源于設計（Quality by Design，QbD）原則要求進行高通量實驗，這樣才可以識別和徹底理解實驗過程中的參數和產品質量間的相互關系。因此實驗設計（DOE）研究會產生大量的樣品，其數量將大大超出使用HPLC和毛細管電泳設備進行蛋白質量分析的實驗室的分析能力。LC GX II則可輕松滿足這種高通量需求，同傳統方法相比，它的速度得到大幅度地提高，另外，其設備精確度、動力學范圍以及分辨率還可滿足蛋白純度分析的要求。安進公司發表過一篇關于單克隆抗體篩選的文章，作者Greg Flynn博士的結論是：LabChip蛋白分析技術在達到同傳統的毛細管技術相當的靈敏度和分辨率時，速度提高了近70倍。

 
LabChip蛋白分析技術與傳統毛細管技術的比較

2. 高通量N-聚糖研究

鏈接在重組單克隆抗體（rMabs）的Fc區域的Asn-X位置的N聚糖已表明可以影響藥代動力學，藥效以及治療安全性。抗體生產過程中介質，pH值，溫度等條件的變化都會影響糖基化的結構。考慮到聚糖對于抗體治療性特征來說具有的重要意義，各家藥物生產商必須能夠在生產中測量并控制糖基化過程，這就需要一整套糖分析模塊系統來確認各批次藥物在糖基化關鍵性治療屬性上的一致性。而且，藥物設計和開發過程中優化糖基化作用可有助于顯著增強藥物性能，并減少臨床應用中的安全風險。如果用傳統的層析技術，CE-LIF技術或者質譜技術來分析N-聚糖，通常需要3天的時間來進行消化、標記和分析，而在LC GX II上使用N聚糖分析試劑盒來做這項工作，這一過程將從3天縮短為不超過6個小時。輝瑞的一份研究報告也曾比較過LabChip N-聚糖分析技術和傳統的NPLC和CELIF方法，結果發現LabChip技術的速度是NPLC的160倍，是CE-LIF的6倍。