目前，驗證全基因組關聯(lián)分析（GWAS）顯著位點的能力尚未跟上其發(fā)現(xiàn)的速度——這被稱為“變異到功能之間的鴻溝（variant to function gap）”。功能基因組學是研究基因功能的金標準，然而，傳統(tǒng)的研究方法往往缺乏空間背景信息。

空間Perturb-Seq（Spatial Perturb-Seq）是一個具有廣泛應用前景的平臺，它通過將多重CRISPR擾動與完整體內組織的單細胞空間轉錄組學相結合，克服了這一難題。這使得研究者能夠同時考察基因功能對細胞自身的調控（細胞自主性效應）以及對周圍環(huán)境或鄰近細胞的影響（非細胞自主性效應）。

通過使用Xenium原位技術對組織進行分析，我們將其性能與基于測序的空間轉錄組學平臺進行了基準測試，展示了其在檢測通量、靈敏度、準確性和空間分辨率方面的互補優(yōu)勢。除了對單個細胞進行空間分析外，我們還利用空間轉錄組學在原位繪制了細胞間通訊網(wǎng)絡。