目前，驗(yàn)證全基因組關(guān)聯(lián)分析（GWAS）顯著位點(diǎn)的能力尚未跟上其發(fā)現(xiàn)的速度——這被稱為“變異到功能之間的鴻溝（variant to function gap）”。功能基因組學(xué)是研究基因功能的金標(biāo)準(zhǔn)，然而，傳統(tǒng)的研究方法往往缺乏空間背景信息。

空間Perturb-Seq（Spatial Perturb-Seq）是一個(gè)具有廣泛應(yīng)用前景的平臺(tái)，它通過將多重CRISPR擾動(dòng)與完整體內(nèi)組織的單細(xì)胞空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)相結(jié)合，克服了這一難題。這使得研究者能夠同時(shí)考察基因功能對(duì)細(xì)胞自身的調(diào)控（細(xì)胞自主性效應(yīng)）以及對(duì)周圍環(huán)境或鄰近細(xì)胞的影響（非細(xì)胞自主性效應(yīng)）。

通過使用Xenium原位技術(shù)對(duì)組織進(jìn)行分析，我們將其性能與基于測(cè)序的空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)平臺(tái)進(jìn)行了基準(zhǔn)測(cè)試，展示了其在檢測(cè)通量、靈敏度、準(zhǔn)確性和空間分辨率方面的互補(bǔ)優(yōu)勢(shì)。除了對(duì)單個(gè)細(xì)胞進(jìn)行空間分析外，我們還利用空間轉(zhuǎn)錄組學(xué)在原位繪制了細(xì)胞間通訊網(wǎng)絡(luò)。