lncRNA 高通量篩選利器，同時檢測lncRNA和mRNA的表達量變化
長鏈非編碼RNA (LncRNA)是一類長度超過200nt的RNA，它們本身并不編碼蛋白，而是以RNA的形式在多種層面上（表觀遺傳調控、轉錄調控以及轉錄后調控等）調控基因的表達水平。近年來的研究表明：LncRNA廣泛參與各種生物學過程，LncRNA的異常表達與包括癌癥在內的多種疾病密切相關。通過LncRNA芯片，研究人員能夠快速高通量的獲得與特定生物學過程或者疾病相關的LncRNA的表達變化，從而為后續的LncRNA功能研究或生物標志物篩選提供極大的便利。
Arraystar LncRNA芯片可同時檢測LncRNA和mRNA，迄今為止，國內客戶采用Arraystar LncRNA芯片已發表的SCI論文已超600篇，其中多篇發表在Cancer Cell，Mol Cell，Hepatology，Blood，EMBO等國際頂尖雜志上。
現Arraystar lncRNA芯片已全面升級至人V.50，小鼠V4.0，大鼠V3.0，新增了lncRNA全長信息，并更新或增加了注釋信息，將提供更加豐富的報告結果，便利科學家進行后續研究。
芯片特點
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本次Arraystar lncRNA芯片升級，新增注釋如下：
序列完整性(Completeness)*: 完整的lncRNA 5’末端序列和3’末端序列對于lncRNA的后續研究至關重要，比如查找lncRNA的精確轉錄起始位點和啟動子區域，以及CRISPR-Cas系統靶點設計等。根據序列完整程度， lncRNA分別注釋為Complete 5’end、Complete 3’end 和 Full length等三類。
表觀基因組信息(Epigenomic_context & DHS_context)* : lncRNAs的轉錄過程受到啟動子或者增強子調控。啟動子和增強子是經典的DNA順式調控元件，帶有各自特有的表觀遺傳標記。活躍的啟動子或增強子自身也是轉錄單位，能產生有功能的非編碼RNA。因此，可根據表觀基因組信息（如DNase I超敏位點）將lncRNA分為啟動子-lncRNA（p-lncRNA）和增強子-lncRNA（e-lncRNA）。其中，根據基因組結構，可將p-lncRNA進一步細分為intergenic p-lncRNA和divergent p-lncRNA。p-lncRNA的表達常和該啟動子調控的蛋白編碼基因的轉錄水平存在正相關關系； 而e-lncRNA則可以捕獲轉錄因子到轉錄位點、調節染色體結構、組織形成細胞核三維拓撲結構域等，從而調控靶基因的轉錄。
亞細胞定位** lncRNA的分子功能與其所在的亞細胞位置密切相關。比如，位于細胞核或染色體上的lncRNA常通過影響表觀遺傳修飾和轉錄過程來調控基因表達。細胞質中的lncRNA則更可能參與翻譯調控或通過吸附miRNA來發揮ceRNA功能。
短肽編碼潛能* 雖然大部分lncRNA不具備蛋白編碼功能，但有些lncRNA含有小的開放閱讀框（smORFs），具備編碼短肽的能力。芯片注釋包含了LncRNAWiki數據庫中預測或實驗驗證過的短肽編碼信息。
miRNA識別位點 預測或經實驗驗證的miRNA識別位點可以很好地幫助客戶尋找lncRNA在miRNA調控網絡中的潛在調節功能，如作為ceRNA發揮作用。 |
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- 設計針對lncRNA不同轉錄本異構體的轉錄本特異性探針，對不同轉錄本檢測更準確、特異性更高 Learn more>>
- 同時檢測lncRNA與mRNA，便于調控型lncRNA與編碼蛋白的mRNA之間共表達及關聯研究
*適用于Human V5.0 ** 適用于Human V5.0 和 Mouse V4.0
Arraystar公司LncRNA芯片產品列表
| 芯片 |
規格 |
描述 |
| Human LncRNA Microarray V5.0 |
8x60k |
39,317 LncRNAs and 21,174 mRNAs |
| Mouse LncRNA Microarray V4.0 |
8x60k |
37,949 LncRNAs and 22,692 mRNAs |
| Rat LncRNA Microarray V3.0 |
4x44k |
10,582 LncRNAs and 27,770 mRNAs |
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